57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2718 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  93.12 
 
 		 177 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  79.88 
 
 		 181 aa  266  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  81.53 
 
 		 177 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  78.66 
 
 		 305 aa  263  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  80.5 
 
 		 177 aa  261  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  80.25 
 
 		 177 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  72.73 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  77.71 
 
 		 181 aa  254  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  78.34 
 
 		 181 aa  253  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  77.71 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  72.73 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  79.33 
 
 		 281 aa  249  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  75.16 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  77.42 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  75.8 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  76.97 
 
 		 152 aa  244  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  71.97 
 
 		 181 aa  243  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  75.16 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  58.24 
 
 		 175 aa  192  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  40.24 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  41.89 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  40.94 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  39.6 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  42.11 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  40.37 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  40.27 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  39.58 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  41.06 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  39.31 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  42.18 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  37.58 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  39.86 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  38.12 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  44 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  37.13 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  39.47 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  38.78 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  38.78 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  41.61 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  38.93 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  37.85 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  40.54 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  35.57 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  38.19 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  40.27 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  38.67 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  32.7 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  40.38 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>