More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0153 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0153  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  44.96 
 
 
257 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.32 
 
 
256 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.9 
 
 
179 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  49.07 
 
 
256 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 
287 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.4 
 
 
289 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
291 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 
269 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  48.28 
 
 
257 aa  99  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  42.03 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  37.16 
 
 
292 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  46.4 
 
 
290 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  42.57 
 
 
338 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  38.15 
 
 
305 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  39.08 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  39.16 
 
 
288 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  50.45 
 
 
305 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 
266 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 
251 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  34.97 
 
 
251 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  41.26 
 
 
286 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
264 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  35.92 
 
 
299 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  28.43 
 
 
271 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  42.5 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
271 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 
307 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  40.65 
 
 
267 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  45.38 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  41.96 
 
 
288 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  47.17 
 
 
283 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  37.61 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  36.18 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  36.18 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  36.11 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 
272 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  41.44 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  36.75 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  32.91 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  38.36 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  38.36 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  35.71 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  46.84 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  37.98 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  36.8 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
258 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  44.05 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  37.04 
 
 
285 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  38.46 
 
 
295 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 
280 aa  82  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  37.04 
 
 
285 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  36.3 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  30.13 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  30.13 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  43.37 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  38.46 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  32.89 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  36.3 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  33.83 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  30.13 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  44.26 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  39.78 
 
 
648 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  33.88 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  29.49 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.89 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  34.4 
 
 
261 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  33.83 
 
 
295 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  34.4 
 
 
261 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  37.65 
 
 
275 aa  79  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
362 aa  78.2  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 
275 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  35.34 
 
 
525 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  33.15 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2736  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  35.34 
 
 
525 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  39.25 
 
 
306 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  39.25 
 
 
306 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  39.25 
 
 
306 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  36.97 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>