More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1072 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1072  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  373  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.205087  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3809  hypothetical protein  73.74 
 
 
203 aa  266  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  45.08 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  43.01 
 
 
195 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  44.62 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  43.68 
 
 
193 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  45.31 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  39.59 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  47.03 
 
 
194 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  43.46 
 
 
198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.75 
 
 
200 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  41.84 
 
 
198 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  43.01 
 
 
194 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  39.6 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  39.6 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  40.8 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  40.95 
 
 
226 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  42.57 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.21 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.99 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  42.42 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  43.56 
 
 
197 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  42.65 
 
 
223 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  40.85 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  40.38 
 
 
219 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  37.37 
 
 
200 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  42.57 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  41.46 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.61 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.72 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.51 
 
 
202 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  39.9 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.7 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  35.57 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  40.31 
 
 
198 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.1 
 
 
190 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.14 
 
 
203 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.38 
 
 
204 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.63 
 
 
203 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.45 
 
 
189 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  34.48 
 
 
234 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.63 
 
 
203 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.63 
 
 
203 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  40.41 
 
 
195 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  35.2 
 
 
200 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  39.27 
 
 
220 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.11 
 
 
203 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  39.06 
 
 
196 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.82 
 
 
189 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  41.58 
 
 
208 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  41.62 
 
 
201 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.93 
 
 
189 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  33.48 
 
 
235 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.12 
 
 
193 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.88 
 
 
207 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  33.48 
 
 
235 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  34 
 
 
207 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  35.65 
 
 
235 aa  101  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3164  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.11 
 
 
203 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.226003  normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1193  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.11 
 
 
203 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1226  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.11 
 
 
203 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018148  normal  0.553858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2991  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.74 
 
 
197 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.701481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1149  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.11 
 
 
203 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000383384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.31 
 
 
192 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  38.07 
 
 
209 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0828  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.06 
 
 
195 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00106663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.68 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  35.23 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  42.13 
 
 
201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.2 
 
 
235 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  33.17 
 
 
220 aa  99  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.27 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  34.39 
 
 
205 aa  99  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  34.2 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  42.27 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.41 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  42.29 
 
 
210 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.39 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.54 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.42 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.15 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  40.1 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.53 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0666  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.33 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.1 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.09 
 
 
216 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1155  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.86 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.18 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.1 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.09 
 
 
216 aa  96.3  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.09 
 
 
216 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.94 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2327  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.52 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  0.01581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.66 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2815  protein of unknown function DUF205  40.44 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.18 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>