51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0571 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  95 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  62.63 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  58.59 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  47.47 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  51.09 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  37 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  31 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  31 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  31 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  30.21 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  31.43 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  35.63 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6203  nitrogen regulatory protein P-II  32.47 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.49 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.17 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  30.38 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  28.75 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  28.57 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  28.57 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  28.57 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  30.38 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  32.89 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  29.11 
 
 		 112 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>