15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3028 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  100 
 
 		 110 aa  223  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  77.27 
 
 		 110 aa  186  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  76.36 
 
 		 110 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  76.36 
 
 		 110 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  70.48 
 
 		 105 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  63.46 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  31.25 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  30.21 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  34.31 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  32.04 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  31.68 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  29.29 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  30.93 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>