18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1293 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  194  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  69.7 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  54.55 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  59 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  48.48 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  47.47 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  48 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  47.31 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  45.65 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  39.08 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  31 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  32.04 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  29 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  29 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  33 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  30.48 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>