18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1404 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  62.63 
 
 
100 aa  140  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  61.62 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  58.59 
 
 
100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  58.59 
 
 
100 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  54.55 
 
 
100 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  99  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  45.16 
 
 
100 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  28.26 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  33.66 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  31.68 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  31.68 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  30.48 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  31.68 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  31.87 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0906  nitrogen regulatory protein P-II  27.18 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>