21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2664 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  65.66 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  59.6 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  58.59 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  58.59 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  59 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  53 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  40.86 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  39.08 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  34.29 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  33.66 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  36 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  30.69 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  30.69 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  38.64 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  38.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  29.7 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  32.91 
 
 		 562 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  32.05 
 
 		 124 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>