18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4476 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  47.31 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  47.31 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  45.16 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  40.86 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  39.78 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  39.78 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  36.08 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  38 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  34.02 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  35.05 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  36.08 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  36.08 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  34 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  33.71 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  27.88 
 
 		 105 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>