19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0486 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  199  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  35 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  34 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  37 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  37 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  32.32 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  32.32 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  31.31 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  32 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  29.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4330  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.1 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4324  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.1 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.913488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  29.67 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  24.71 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0110  nitrogen regulatory protein P-II  27.88 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.762819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>