15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1279 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  91.82 
 
 
110 aa  215  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  76.36 
 
 
110 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  66.67 
 
 
105 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  64.42 
 
 
104 aa  142  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  36.08 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  32 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  30.69 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  31 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  34.58 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  31.68 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  29 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  31.37 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>