31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3849 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 100 aa  205  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  95 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  61.62 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  59.6 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  48.48 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  48.48 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  37 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  35.24 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  32 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  32 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  32 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  31.25 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  31.43 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  31.03 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  35.96 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  31.17 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3238  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6203  nitrogen regulatory protein P-II  32.47 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  29.11 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  29.87 
 
 		 112 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.87 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  27.5 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.21 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  30.49 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  26.58 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  28.57 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>