18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1968 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  31.43 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  31.43 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3238  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2931  nitrogen regulatory protein P-II  26.92 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  30.48 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  30.48 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3831  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  26.92 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  26.67 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2652  nitrogen regulatory protein P-II  27 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4330  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.11 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4324  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.11 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.913488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0110  nitrogen regulatory protein P-II  29.81 
 
 		 103 aa  42  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.762819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  27.88 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1989  hypothetical protein  24 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  29.7 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>