19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1131 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  65.66 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  69.7 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  58.59 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  55.56 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  54.55 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  52.53 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  47.31 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  41.18 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  39.08 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  34.31 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  30.48 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0906  nitrogen regulatory protein P-II  27.18 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>