18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3695 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  53 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  52.53 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  48.48 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  48 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  51.09 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  38 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0846  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0262009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5564  hypothetical protein  36.05 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  32 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  30.93 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  31.96 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  31.37 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  31.37 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  30.39 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>