17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1476 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  213  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1272  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1248  hypothetical protein  64.42 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1279  hypothetical protein  64.42 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.119981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5062  hypothetical protein  64.42 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.983534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3028  plasma membrane protein of unknown function  63.46 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4476  hypothetical protein  34.02 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  35.24 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0571  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00607957  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2664  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19416  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1293  hypothetical protein  30 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0972857  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1404  nitrogen regulatory protein P-II  30.48 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00129286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0110  nitrogen regulatory protein P-II  32.04 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.762819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3695  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3238  hypothetical protein  27.18 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>