14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3238 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3238  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  205  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0110  nitrogen regulatory protein P-II  80.58 
 
 		 103 aa  168  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.762819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3831  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.54 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2931  nitrogen regulatory protein P-II  30.1 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1989  hypothetical protein  30.1 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4324  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.1 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.913488  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4330  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.1 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4043  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.1 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  30.77 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2652  nitrogen regulatory protein P-II  28.87 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0878  nitrogen regulatory protein P-II  28.87 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0906  nitrogen regulatory protein P-II  28.87 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1476  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.551693  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3849  nitrogen regulatory protein P-II  30.21 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171847  unclonable  0.00000715537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>