16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0878 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0878  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 108 aa  216  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0906  nitrogen regulatory protein P-II  84.11 
 
 		 111 aa  187  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2652  nitrogen regulatory protein P-II  82.24 
 
 		 108 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4043  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.47 
 
 		 108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1989  hypothetical protein  75 
 
 		 108 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4324  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.58 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.913488  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4330  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.58 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2931  nitrogen regulatory protein P-II  69.81 
 
 		 119 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0279  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0274  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2951  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.08 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3831  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  27.27 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3238  hypothetical protein  28.87 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0110  nitrogen regulatory protein P-II  28.87 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.762819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  27.08 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0337  nitrogen regulatory protein P-II  31.25 
 
 		 97 aa  42  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>