18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4330 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4330  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 108 aa  217  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4324  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 108 aa  217  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.913488  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4043  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  94.44 
 
 		 108 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2931  nitrogen regulatory protein P-II  83.33 
 
 		 119 aa  186  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.762572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1989  hypothetical protein  82.41 
 
 		 108 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0878  nitrogen regulatory protein P-II  73.58 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2652  nitrogen regulatory protein P-II  72.64 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0906  nitrogen regulatory protein P-II  73.58 
 
 		 111 aa  161  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0274  hypothetical protein  38.38 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0279  hypothetical protein  38.38 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3238  hypothetical protein  30.1 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3831  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.16 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0110  nitrogen regulatory protein P-II  25.24 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.762819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2951  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.16 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.17 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1968  hypothetical protein  32.11 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0233024  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0486  hypothetical protein  30.1 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02411  hypothetical protein  24.72 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.261371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>