52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7166 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  193  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  46.07 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  46.84 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  46.91 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  46.91 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  42.35 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  45.45 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  43.68 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  41.54 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  45.07 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  45.07 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  36.56 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  40.79 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  46.55 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  32.43 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  45.45 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  38.71 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  39.66 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  34.62 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  31.03 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  35.21 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  33.7 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  40 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  40 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  38.98 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1603  hypothetical protein  40.68 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549542  normal  0.574337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  35 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0231  hypothetical protein  39.13 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  30.95 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  35.9 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  34.12 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  34.12 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  31.75 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  33.85 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  30.12 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  31.58 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  30.67 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  30.12 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  46.55 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  30.68 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  26.74 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  31.4 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>