53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2075 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  98.64 
 
 
147 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  98.64 
 
 
147 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  84.77 
 
 
151 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  58.5 
 
 
140 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  59.71 
 
 
141 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  39.13 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  43.86 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  51.58 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  41.18 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  56.25 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  36.13 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  36.13 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  40.21 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  42.11 
 
 
94 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  36.67 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  39.29 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  50.82 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0231  hypothetical protein  38.14 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68703  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  46.67 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  34.94 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1603  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549542  normal  0.574337 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  33.72 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  33.68 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  35.35 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  33.73 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  35.82 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  43.9 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  43.9 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  32.5 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  29.79 
 
 
97 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  34.92 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  37.88 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  25 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  36.84 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  36.84 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  30.86 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  35.09 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  37.66 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  31.87 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  32.79 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  27.78 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  26.83 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  32.2 
 
 
85 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6196  hypothetical protein  36.9 
 
 
92 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  30.95 
 
 
90 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  28.21 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  32 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>