47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0491 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  283  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  283  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  98.64 
 
 
147 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  84.77 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  58.5 
 
 
140 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  62.22 
 
 
141 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  38.26 
 
 
131 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  50.53 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  43.86 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  40.34 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  54.69 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  35.29 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  35.29 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  39.18 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  39.58 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  35.83 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  38.1 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  49.18 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0231  hypothetical protein  37.11 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68703  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  45 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  35.35 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  33.68 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1603  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549542  normal  0.574337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  33.73 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  32.56 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  32.53 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  31.67 
 
 
100 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  34.33 
 
 
74 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  42.68 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  42.68 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  32.81 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  28.72 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  36.36 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  35.09 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  35.09 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  30.86 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  23.96 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  29.63 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  36.36 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  30.77 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  30.95 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  31.15 
 
 
88 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>