30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0231 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  186  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0231  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68703  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  40.91 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  56 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  41.11 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  39.08 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  53.19 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  42.25 
 
 
126 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  42.25 
 
 
126 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  46.94 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  48.98 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  48.98 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  48.98 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  48.98 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  48.98 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  43.75 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  46.94 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  46.94 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  48.94 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  41.86 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  42.86 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  32.14 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  41.67 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  35.42 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6196  hypothetical protein  51.72 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>