54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3215 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  56.63 
 
 
107 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  46.67 
 
 
104 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  46.74 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  36.13 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  34.19 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  61.02 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  42.06 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  45.21 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  45.21 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  45.21 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  45.21 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  45.21 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  46.97 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  43.59 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  43.84 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  43.84 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  40.51 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  44 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1603  hypothetical protein  45.83 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549542  normal  0.574337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  49.12 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  43.55 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  43.86 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  33.72 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  46.67 
 
 
111 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  47.27 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  47.27 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  35.06 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  31.33 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  35.71 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  32.43 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  45.28 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0231  hypothetical protein  51.22 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  35.37 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  34.43 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  33.8 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  39.34 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  33.75 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  33.75 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  33.87 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  30.77 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  28.38 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  34.48 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  29.11 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  31.08 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6196  hypothetical protein  34.44 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  30.86 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>