45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0654 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  50.65 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  39.53 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  41.77 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  40.45 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  43.01 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  40.48 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  48.33 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  36.9 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  43.08 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  38.3 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  40.91 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  36.47 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  34.25 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  34.25 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  32.91 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  28.36 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  27.16 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  37.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  27.16 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  27.16 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  27.16 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  27.16 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  27.16 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  32.88 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  32.88 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  33.85 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  25.93 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  28.77 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  25.93 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  28.26 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  23.53 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  25.88 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  25.4 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  26.56 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  25.3 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>