14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1115 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  43.08 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  37.31 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  35.37 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  37.7 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  40.62 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  41.07 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  30.23 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  28.26 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  33.85 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  32.31 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  34.41 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  31.67 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>