37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2421 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  58.82 
 
 
92 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  46.99 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  43.96 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  50.6 
 
 
88 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  40.45 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  47.13 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  42.7 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  44.94 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  48.53 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  42.86 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  42.5 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  45.45 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  38.24 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  38.2 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  42.19 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  34.83 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  35.23 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  35.23 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  43.08 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  36.14 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  30.16 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  30.16 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  31.33 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  32.88 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  29.33 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0490  hypothetical protein  28.07 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  29.31 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  22.5 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1303  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  28.92 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  26.97 
 
 
89 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>