27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4934 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  56.67 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  40.91 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  39.77 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  41.11 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  37.97 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  47.46 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  39.08 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  39.08 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  34.83 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  42.19 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  35.48 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  41.51 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  34.48 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  35.19 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  31.46 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  30.38 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  30.16 
 
 		 99 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  32.18 
 
 		 90 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  31.48 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  31.48 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>