48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1210 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  74.12 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  62.35 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  47.44 
 
 		 87 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  45.78 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  50.63 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  47.5 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  45.95 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  43.37 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  51.52 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  45.35 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  46.99 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  48.33 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  31.4 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  32.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  32.56 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  34.21 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  33.72 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  33.72 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  37.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  31.71 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  31.82 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  31.82 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  31.17 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  26.37 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  29.11 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  29.11 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  29.11 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  29.11 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  29.11 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  30.16 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  31.03 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  31.67 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  32.76 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  32.76 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  32.2 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  27.85 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  27.85 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  25.71 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>