37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3287 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  48.94 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  40.82 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  39.53 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  35.37 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  35.82 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  35.8 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  39.19 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  36.07 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  35.48 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  31.65 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  31.33 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  31.33 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  33.9 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0231  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68703  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  28.95 
 
 		 203 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  27.63 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549542  normal  0.574337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1863  hypothetical protein  34.94 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2198  hypothetical protein  34.94 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  33.93 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6196  hypothetical protein  26.44 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>