44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1603 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1603  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549542  normal  0.574337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  74.42 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  55.81 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4960  hypothetical protein  73.33 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  44.87 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  45.16 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  45.16 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  47.69 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  32.35 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  39.39 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  39.39 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  39.39 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  39.39 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  39.39 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  36.9 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  40.62 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3287  hypothetical protein  36.59 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  33.82 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  35.16 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  40.35 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  40.68 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  39.34 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  40.38 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  25.88 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  35.19 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  35.19 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  27.12 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  24.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  32.18 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6196  hypothetical protein  34.48 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  23.96 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  30.91 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1577  hypothetical protein  30.86 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  25.53 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1634  hypothetical protein  30.86 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>