20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3074 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  45.98 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  44.05 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  45.12 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1783  hypothetical protein  49.37 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0218342  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1861  peptidase  43.68 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2589  hypothetical protein  44.93 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0869265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0619  hypothetical protein  39.76 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.669584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  34.57 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2565  hypothetical protein  37.08 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84434  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  32.95 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  34.62 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  32.58 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  36.67 
 
 		 126 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>