24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0640 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  177  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  173  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0619  hypothetical protein  66.67 
 
 		 99 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.669584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  45.12 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  40.7 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1783  hypothetical protein  40.48 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0218342  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  44.78 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2589  hypothetical protein  39.06 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0869265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  40.74 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1861  peptidase  41.67 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  26.67 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  34.88 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  34.88 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2565  hypothetical protein  36.47 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84434  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3781  hypothetical protein  40.58 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5155  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0490  hypothetical protein  38.33 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  35.96 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  37.68 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  34.25 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>