25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0490 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0490  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  218  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5097  hypothetical protein  36.59 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166278  normal  0.117299 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  33.75 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  36 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  31.4 
 
 
88 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  40.24 
 
 
87 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  34.55 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.73 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  32.84 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  37.88 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  36.99 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  29.41 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  33.77 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  35.21 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  37.84 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  37.84 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  31.43 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  28 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3781  hypothetical protein  39.29 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3461  putative exported protein of unknown function  35.59 
 
 
357 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  30.91 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  36.62 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3038  antenna complex, alpha/beta subunit  40.82 
 
 
239 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  30.59 
 
 
97 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  34.92 
 
 
85 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>