40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3038 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3038  antenna complex, alpha/beta subunit  100 
 
 		 239 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0209  antenna complex, alpha/beta subunit  84 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6158  light-harvesting complex alpha subunit  84 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0980  antenna complex, alpha/beta subunit  59.18 
 
 		 54 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  45.4 
 
 		 1065 aa  69.3  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6256  LHII alpha, light-harvesting B800/850 protein  57.14 
 
 		 54 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1959  antenna complex, alpha/beta subunit  57.14 
 
 		 54 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3082  light harvesting protein B-800-850, alpha chain  47.06 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16331  hypothetical protein  50.83 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.377957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1582  antenna complex, alpha/beta subunit  59.57 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3421  antenna complex alpha/beta subunit  51.02 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1334  antenna complex, alpha/beta subunit  48.98 
 
 		 67 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4447  antenna complex, alpha/beta subunit  53.19 
 
 		 59 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1679  antenna complex alpha/beta subunit  46.94 
 
 		 59 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2399  antenna complex, alpha/beta subunit  51.02 
 
 		 59 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0690333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2926  antenna complex alpha/beta subunit  46.94 
 
 		 59 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3784  antenna complex, alpha/beta subunit  48.94 
 
 		 65 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.821557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4771  antenna complex alpha/beta subunit  48.94 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3891  antenna complex, alpha/beta subunit  46.94 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00637036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2863  antenna complex, alpha/beta subunit  48.94 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2609  antenna complex, alpha/beta subunit  48.94 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142942  hitchhiker  0.00280772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0220  antenna complex, alpha/beta subunit  48.94 
 
 		 67 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00667798  decreased coverage  0.00260316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2899  putative light-harvesting protein B-800/850 alpha chain  56.25 
 
 		 113 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3786  antenna complex, alpha/beta subunit  44.9 
 
 		 59 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0407827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1239  antenna complex, alpha/beta subunit  44.9 
 
 		 59 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000000666416  unclonable  0.0000000160108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4032  antenna complex, alpha/beta subunit  44.9 
 
 		 59 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.460767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3788  antenna complex, alpha/beta subunit  46.94 
 
 		 59 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3419  antenna complex alpha/beta subunit  48.98 
 
 		 65 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.540512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4441  antenna complex, alpha/beta subunit  47.92 
 
 		 65 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.562609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  36 
 
 		 682 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2392  antenna complex, alpha/beta subunit  46.94 
 
 		 65 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0783  hypothetical protein  46.24 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.024345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  30.73 
 
 		 548 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 1022 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  31.72 
 
 		 575 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  35.4 
 
 		 1088 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  30.73 
 
 		 524 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  41.48 
 
 		 570 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  36.15 
 
 		 440 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  36.15 
 
 		 440 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>