45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1895 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  96.55 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  72.94 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  77.01 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  53.85 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  48.84 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  59.7 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  50.72 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  42.7 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  47.13 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  53.73 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  40.48 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  37.78 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  43.37 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  42.53 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  42.53 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  32.95 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  31.52 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  43.86 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  44.26 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  37.18 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  35.96 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  35.06 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0227  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  34.29 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  33.85 
 
 		 122 aa  43.9  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  34.92 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  34.92 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0228  hypothetical protein  34.52 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0490  hypothetical protein  37.7 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  32.2 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1303  hypothetical protein  34.55 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  27.42 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  27.42 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  31.75 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  33.93 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>