40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  77.01 
 
 		 87 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  77.01 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  51.11 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  47.67 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  56.72 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  47.73 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  38.27 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  37.35 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  36.26 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  47.76 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  37.8 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  35.56 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  37.36 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  43.53 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  43.53 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  43.64 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  39.06 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  36.36 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  36.36 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  39.34 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  39.34 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  39.44 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  36.9 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2736  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1303  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5694  hypothetical protein  36.76 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167146  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7166  hypothetical protein  46.55 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.600167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  31.67 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  32.31 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  31.75 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  29.07 
 
 		 140 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>