21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5694 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5694  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167146  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1303  hypothetical protein  84.06 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  45 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  37.97 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  38.75 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  35.21 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  38.18 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  29.76 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  41.38 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  41.38 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  38.18 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  32.94 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  38.89 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  32.79 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>