29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2249 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  190  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  44.19 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  48.05 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  44.94 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  40.79 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  36.05 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  40.74 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  45.21 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  46.15 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  47.62 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  42.11 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  37.68 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1115  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  32.14 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  32.14 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  35.14 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  32.05 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  34.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  27.4 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>