53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2808 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3510  hypothetical protein  41.38 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4514  signal peptide protein  36.47 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  34.12 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4948  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4628  hypothetical protein  35.71 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6036  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234756  normal  0.35879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3147  putative signal peptide protein  40 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  hitchhiker  0.000526488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2421  hypothetical protein  35.23 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440157  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5391  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2353  signal peptide protein  38.1 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.736967  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3659  hypothetical protein  36.47 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5167  hypothetical protein  36.59 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2915  hypothetical protein  37.18 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0234113  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1934  hypothetical protein  38.75 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6191  hypothetical protein  29.55 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0902  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0923953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03471  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6260  hypothetical protein  34.21 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0654  hypothetical protein  34.25 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10110  hypothetical protein  40.32 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000257436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1895  hypothetical protein  41.27 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1883  hypothetical protein  32.18 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3288  hypothetical protein  37.29 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.085788 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2249  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3285  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0921239 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0211  hypothetical protein  37.29 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1210  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  34.52 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  34.88 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4934  hypothetical protein  35 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3434  hypothetical protein  35.59 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0270  hypothetical protein  29.27 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3400  hypothetical protein  33.85 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1810  hypothetical protein  35 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3215  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1289  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.955521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4086  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.752726  normal  0.368049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0511  putative signal peptide protein  31.15 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal  0.0104186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0527  putative signal peptide protein  31.15 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3093  hypothetical protein  27.63 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6196  hypothetical protein  28.74 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>