17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1643 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  184  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  55.81 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1783  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0218342  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  39.29 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0619  hypothetical protein  55.56 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.669584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2808  hypothetical protein  37.93 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1490  hypothetical protein  37.93 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  37.97 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1861  peptidase  40.98 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  25.88 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2589  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0869265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5578  hypothetical protein  29.76 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  38.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2565  hypothetical protein  29.63 
 
 		 89 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84434  normal  0.433178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>