182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0387 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0387  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.296672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2041  arsenate reductase and related  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0849  arsenate reductase  96.3 
 
 		 108 aa  216  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0770  arsenate reductase and related  57.41 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.224236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4041  arsenate reductase and related  49.04 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1095  arsenate reductase and related  46.67 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1726  arsenate reductase and related  46.23 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  37.27 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  41.75 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  40.37 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  36.28 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  36.89 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  40.82 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  39.29 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2255  arsenate reductase and related  37.25 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  34.82 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  35.92 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  34.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1552  ArsC family protein  39.22 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  35.4 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  34.51 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0559  hypothetical protein  37.84 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  36.54 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  34.51 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  34.51 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  38.61 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  37.14 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  34.82 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  39.78 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  36.84 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  33.63 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  36.28 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  35.92 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  36.19 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  32.74 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  35.92 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  32.38 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  35.58 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  39.18 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1277  arsenate reductase and related  40.21 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300917  normal  0.698716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  40.86 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  39.18 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  31.86 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  38.71 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  38.14 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  38.14 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  38.14 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  38.14 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  35.64 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  34.65 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  34.95 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  35.29 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  33.01 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  35.51 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  36.61 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  40.86 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  40.86 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  40.86 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  36.79 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  32.74 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  35.05 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  35.64 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  36.19 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  34.26 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  35.48 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  38.46 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  32.69 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  33.01 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  38.46 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  38.46 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0080  arsenate reductase and related  37.5 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  33.66 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  36.79 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  39.58 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  32.69 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  33.66 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  32.08 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  34.02 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  38.46 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  34.34 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  33.65 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  34.78 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  33.66 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  33.98 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  39.78 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  36.46 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  34.65 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1829  arsenate reductase and related  31 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492435  unclonable  0.000000000467548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  35.87 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  31.07 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>