166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1726 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1726  arsenate reductase and related  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0770  arsenate reductase and related  56.31 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.224236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1095  arsenate reductase and related  51.92 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0387  hypothetical protein  46.23 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.296672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2041  arsenate reductase and related  46.23 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0849  arsenate reductase  45.28 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4041  arsenate reductase and related  45.79 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2255  arsenate reductase and related  40 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  46.02 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  41.12 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  38.46 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0559  hypothetical protein  41.44 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  36.36 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  36.36 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  35.45 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1552  ArsC family protein  37.25 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  41.28 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  37.17 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  35.64 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  37.5 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  35.45 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  34.55 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  34.55 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  36.27 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  38.32 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  38.32 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  38.38 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0578  hypothetical protein  33.67 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  35.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  33.64 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  39.39 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  35.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  36.04 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  35.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  35.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  35.14 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  33.63 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  33.01 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  37.38 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  35.14 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  38.38 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  32.14 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1829  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492435  unclonable  0.000000000467548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  36.36 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  35.85 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  38.38 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  35.24 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  36.61 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  36.63 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  33.02 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  36.63 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  34.55 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0567  hypothetical protein  31.63 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  34.23 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  35.4 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  34.65 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  34.23 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  36.79 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  36.79 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  36.79 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  34.23 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  34.23 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  34.23 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  36.46 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  32.29 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  34.23 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  34.23 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  34.23 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  35.24 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  31.43 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  30.97 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  35.64 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  36.45 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  31.63 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  36.46 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  32.43 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  32.41 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  35.58 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>