169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4041 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4041  arsenate reductase and related  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0387  hypothetical protein  49.04 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.296672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2041  arsenate reductase and related  49.04 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0849  arsenate reductase  45.19 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1726  arsenate reductase and related  45.79 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0770  arsenate reductase and related  45.1 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.224236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1095  arsenate reductase and related  37.74 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  36.54 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2255  arsenate reductase and related  39.09 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  36.19 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  34.55 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1552  ArsC family protein  35.29 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  30.56 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  33.66 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  32.67 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  34.95 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  35.09 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  35.64 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  33.64 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  29.7 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0578  hypothetical protein  31.96 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  31.48 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  31.68 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  30.97 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  30.48 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  32.67 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  27.78 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  28.71 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0567  hypothetical protein  32.99 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  30.69 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  31.43 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  31.13 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  32.41 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  31.13 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  31.13 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  31.13 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  31.13 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  31.13 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  28.16 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  30.36 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  32.38 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  34.51 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  29.52 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0559  hypothetical protein  33.03 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401537  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  33.01 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  33.9 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  28.43 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  29.91 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  33.9 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  32.48 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  28.16 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  29.63 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  32.67 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  31.68 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  29.63 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  29.63 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  28.57 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  29.63 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  30.19 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  30.28 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  29.13 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  33.65 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  27.78 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  29.63 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1829  arsenate reductase and related  30.93 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492435  unclonable  0.000000000467548 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0920  arsenate reductase-like protein  28.57 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  32.69 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  32.69 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  26.85 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  32.69 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  26.79 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  31.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  26.73 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  29.46 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  29.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  28.57 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  28.57 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  28.57 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  30.69 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  29.73 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  32.69 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  26.73 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  29.52 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  28.44 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  26.47 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  28.71 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>