78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1382 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1382  serine/threonine phosphatase  100 
 
 
285 aa  596  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0116753  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0944  protein serine/threonine phosphatases  80.7 
 
 
285 aa  484  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000244795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1382  protein serine/threonine phosphatase  24.9 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.344903  hitchhiker  0.00931102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1157  protein serine/threonine phosphatase  23.19 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 
669 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  28.05 
 
 
669 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  24.74 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  25.37 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  28.26 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  24.89 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2768  protein serine/threonine phosphatases  28.88 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  24.49 
 
 
395 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  26.63 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.24 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  22.75 
 
 
435 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  25.64 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  25.64 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.26 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
256 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  27.59 
 
 
478 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  21.93 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  29.05 
 
 
425 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  25.97 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3143  protein serine/threonine phosphatases  28.34 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000847096  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  27.43 
 
 
548 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  21.95 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  25 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  32.92 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  28.49 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  25.87 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  24.07 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  28.48 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  23.83 
 
 
404 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0285  protein serine/threonine phosphatase  23.63 
 
 
257 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506959  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  25.13 
 
 
287 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  28.66 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  26.45 
 
 
252 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.04 
 
 
242 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  25.33 
 
 
325 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  22.61 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
296 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  29.28 
 
 
680 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  23.68 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.32 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  29.37 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  28.79 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  27.18 
 
 
651 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  23.11 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  33.94 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2278  protein serine/threonine phosphatase  27.15 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.591939 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.88 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  23.49 
 
 
624 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  22.82 
 
 
633 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  22.78 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  24.49 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  24.51 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  29.46 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  25.33 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  23.57 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  23.41 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  28.3 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  26.61 
 
 
571 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2970  protein serine/threonine phosphatase  22.82 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.489597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0635  protein serine/threonine phosphatases  20.49 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000299869  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  23.95 
 
 
452 aa  43.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 
538 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.7 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  23.64 
 
 
394 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  23.15 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  27.66 
 
 
445 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  23.05 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl220  serine/threonine phosphatase  23.58 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000356815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  23.08 
 
 
421 aa  42.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  22.33 
 
 
595 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  24.87 
 
 
449 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  28.28 
 
 
261 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>