More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0635 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0635  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000299869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  33.2 
 
 
452 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.85 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.25 
 
 
611 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  31 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  30.07 
 
 
313 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  31.09 
 
 
540 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  31.14 
 
 
597 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  33.97 
 
 
236 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  31.39 
 
 
389 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  30.86 
 
 
421 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.08 
 
 
237 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  31.92 
 
 
469 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 
395 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 
238 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  32.08 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  30.31 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  29.43 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  29.78 
 
 
441 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.43 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 
256 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 
259 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  29.48 
 
 
285 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  30 
 
 
463 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  31.34 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  30.41 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1464  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.42 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  29.6 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 
270 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  31.42 
 
 
337 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  28.95 
 
 
259 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.6 
 
 
417 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.3 
 
 
438 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  32.11 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 
259 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  37.43 
 
 
422 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  32.57 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  31.72 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  28.14 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  30.4 
 
 
466 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  29.03 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.14 
 
 
419 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.15 
 
 
287 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  30.22 
 
 
449 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  29.85 
 
 
571 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
477 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  29.32 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  32.74 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  28.52 
 
 
554 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  28.83 
 
 
474 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  36.87 
 
 
244 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  29.63 
 
 
276 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  30.5 
 
 
243 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2278  protein serine/threonine phosphatase  27.55 
 
 
275 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.591939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 
687 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.1 
 
 
238 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  29.41 
 
 
574 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  29.56 
 
 
478 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  29.45 
 
 
463 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
244 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.23 
 
 
425 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  27.99 
 
 
443 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  29.76 
 
 
467 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  27.38 
 
 
462 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 
474 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  31.87 
 
 
305 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  30.47 
 
 
265 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  31.5 
 
 
507 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  30.83 
 
 
296 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  35.5 
 
 
268 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  27.47 
 
 
548 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  31.01 
 
 
445 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  28.68 
 
 
567 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  30.65 
 
 
264 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.1 
 
 
320 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.2 
 
 
482 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 
241 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  29.59 
 
 
415 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  31.96 
 
 
319 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.55 
 
 
243 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  30.27 
 
 
266 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  27.59 
 
 
256 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  29.89 
 
 
256 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  28.73 
 
 
500 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.77 
 
 
261 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  28.88 
 
 
254 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  30.18 
 
 
419 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  28.78 
 
 
274 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  28.64 
 
 
256 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>