235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0406 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  78.29 
 
 
189 aa  295  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  77.71 
 
 
188 aa  293  8e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  66.26 
 
 
205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  65.81 
 
 
180 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  61.54 
 
 
184 aa  204  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  61.18 
 
 
166 aa  201  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  60.25 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  54.78 
 
 
181 aa  180  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  52.76 
 
 
185 aa  177  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  53.5 
 
 
182 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  53.9 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  53.95 
 
 
175 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  53.29 
 
 
175 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  52.2 
 
 
176 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  52.2 
 
 
176 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 
175 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  50.97 
 
 
173 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0205699 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  48.09 
 
 
318 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  53.25 
 
 
180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  49.68 
 
 
173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 
175 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 
175 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 
175 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  50 
 
 
175 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  49.03 
 
 
173 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  49.7 
 
 
182 aa  151  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  46.88 
 
 
166 aa  137  8.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  38.34 
 
 
321 aa  125  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  43.71 
 
 
310 aa  121  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  36.84 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  36.84 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  36.84 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  36.84 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  36.84 
 
 
135 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  38.26 
 
 
128 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  35.37 
 
 
136 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  36.24 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06332  lactoylglutathione lyase (Glo1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13550)  30.2 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  35.37 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  35.37 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  35.37 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  36.73 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  34.01 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  34.23 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
135 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  33.56 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  34.23 
 
 
131 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  32.89 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  36.24 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
130 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  36.91 
 
 
130 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
130 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  32.24 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  34.42 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  34.01 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  31.97 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  32.89 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  34.23 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  32.89 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  34.9 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  34.23 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  33.77 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  34.44 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  32.89 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  31.79 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  33.77 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  31.29 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  30.68 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  35.33 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  34.23 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02261  putative lactoylglutathione lyase  33.78 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0600753  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  31.79 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  30.92 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  30.2 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  34.23 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  34.23 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  32.89 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  34.23 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>