288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3766 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 175 aa  366  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  98.86 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  97.71 
 
 		 175 aa  359  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  93.14 
 
 		 175 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  82.08 
 
 		 173 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  80.35 
 
 		 173 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  80.35 
 
 		 173 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  71.26 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  68.97 
 
 		 185 aa  250  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  68.64 
 
 		 171 aa  245  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  66.08 
 
 		 175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  65.5 
 
 		 175 aa  236  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  57.63 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  56.98 
 
 		 182 aa  203  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  56.97 
 
 		 180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  55.69 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  55.69 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  54.82 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  56.36 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  53.94 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  55.9 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  51.15 
 
 		 182 aa  174  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  51.81 
 
 		 180 aa  173  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  53.25 
 
 		 318 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  46.29 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  45.71 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  49.69 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  46.5 
 
 		 310 aa  135  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  43.95 
 
 		 321 aa  133  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  38.78 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  36.13 
 
 		 136 aa  91.3  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 		 136 aa  90.9  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  40 
 
 		 130 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 131 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  39.33 
 
 		 128 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  37.33 
 
 		 129 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  38.51 
 
 		 128 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 128 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  37.24 
 
 		 138 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  40.82 
 
 		 127 aa  88.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 130 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  38.78 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  36.91 
 
 		 136 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  39.19 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 129 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  38.1 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 129 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  38.1 
 
 		 137 aa  85.5  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 		 135 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 		 129 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  36.24 
 
 		 138 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  35.14 
 
 		 135 aa  85.1  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  38 
 
 		 129 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 146 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 		 128 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  37.16 
 
 		 145 aa  84.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  38.78 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.81 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  39.19 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  37.24 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  34.64 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  34.67 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  34.46 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  36.55 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  39.46 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  36.6 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  37.41 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  37.33 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  36.55 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  34 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  35.17 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  34.9 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  38.36 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  34.46 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>