289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4207 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 175 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  75.29 
 
 		 173 aa  277  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  71.26 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  71.26 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  70.69 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  71.84 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  72.67 
 
 		 173 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  72.09 
 
 		 173 aa  270  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  65.09 
 
 		 171 aa  238  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  63.95 
 
 		 185 aa  231  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  60.71 
 
 		 175 aa  220  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  60.12 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  52.69 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  54.04 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  54.04 
 
 		 184 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  50 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  54.66 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  52.17 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  54.66 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  51.55 
 
 		 205 aa  180  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  55.48 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  53.33 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  52.12 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  52.29 
 
 		 318 aa  167  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  47.31 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  49.35 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  49.01 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  44.44 
 
 		 321 aa  135  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  43.51 
 
 		 310 aa  127  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 		 136 aa  98.2  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.06 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  36.91 
 
 		 136 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  41.22 
 
 		 130 aa  94.7  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  39.19 
 
 		 130 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  39.86 
 
 		 127 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  38.71 
 
 		 136 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  39.86 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 		 144 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  37.84 
 
 		 129 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  37.67 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  37.67 
 
 		 135 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.04 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  36.99 
 
 		 135 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  38.36 
 
 		 135 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 128 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  36.6 
 
 		 130 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.15 
 
 		 126 aa  91.7  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  37.16 
 
 		 137 aa  91.3  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2466  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.28 
 
 		 146 aa  91.3  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  37.67 
 
 		 135 aa  90.9  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  38.51 
 
 		 132 aa  90.9  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 		 128 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  36.99 
 
 		 138 aa  90.5  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  37.67 
 
 		 138 aa  90.9  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  37.33 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  35.62 
 
 		 138 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  35.62 
 
 		 138 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  37.67 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  37.67 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  38.51 
 
 		 128 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2343  lactoylglutathione lyase  43.92 
 
 		 137 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.973828  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2283  lactoylglutathione lyase  39.04 
 
 		 146 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.36 
 
 		 146 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  36.91 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  38.51 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.36 
 
 		 146 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  37.75 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  35.62 
 
 		 136 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 129 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1268  lactoylglutathione lyase  38.26 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.36 
 
 		 146 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000851602  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0652  glyoxalase I  35.62 
 
 		 129 aa  87.8  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  39.6 
 
 		 128 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  36 
 
 		 132 aa  87.8  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  36.3 
 
 		 137 aa  87.8  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  37.84 
 
 		 129 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1843  hypothetical protein  38.93 
 
 		 146 aa  87.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  34.93 
 
 		 135 aa  87  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1846  hypothetical protein  39.04 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  34.93 
 
 		 135 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1734  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.33 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  34.93 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  35.62 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  34.93 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>