291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2137 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 175 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  97.71 
 
 		 175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  97.71 
 
 		 175 aa  359  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  93.14 
 
 		 175 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  80.92 
 
 		 173 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  80.35 
 
 		 173 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  80.92 
 
 		 173 aa  298  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  71.84 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  68.97 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  68.64 
 
 		 171 aa  244  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  66.08 
 
 		 175 aa  238  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  65.5 
 
 		 175 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  57.63 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  55.81 
 
 		 182 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  56.97 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  55.09 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  55.09 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  56.97 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  54.22 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  53.33 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  52.3 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  54.66 
 
 		 166 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  52.41 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  53.9 
 
 		 318 aa  167  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  45.14 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  44.57 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  49.67 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  45.86 
 
 		 310 aa  133  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  43.95 
 
 		 321 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  39.46 
 
 		 127 aa  95.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  38.26 
 
 		 136 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  38.78 
 
 		 131 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  40 
 
 		 130 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  37.93 
 
 		 138 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  37.58 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  38.78 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  39.33 
 
 		 128 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  39.46 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  35.48 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  38.78 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  38.78 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  37.33 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 128 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  40.41 
 
 		 127 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  38.78 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  38.78 
 
 		 129 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  38.78 
 
 		 137 aa  88.2  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  39.46 
 
 		 128 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 129 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  36.91 
 
 		 138 aa  87.8  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 146 aa  87.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  35.33 
 
 		 128 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 		 135 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 135 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  37.93 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 238 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  39.86 
 
 		 132 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  37.16 
 
 		 145 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  36.24 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 128 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  35.81 
 
 		 136 aa  84  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  34.67 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  38.78 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  33.11 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  38.1 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  38.1 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  34.46 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  38.62 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  35.86 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  36.81 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.81 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  35.86 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  37.16 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  39.46 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  34.46 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  34.9 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  36.81 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  34.57 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>